生物措施主要降解水体中的有机污染负荷。微生物是降解水体有机污染物质的主力军。在黑臭的水体中好氧性微生物无法存活，因此无法起到降解污染物作用，通过人工添加生物酶、微生物种类，即可起到加速污染物降解的效果。